Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms