Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PtprnQ60673 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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