Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms