Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv4Q5R1A3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms