Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms