Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim58Q5NCC9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms