Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms