Protein–RNA interactions for Protein: Q571C7

Bdp1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bdp1Q571C7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bdp1Q571C7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bdp1Q571C7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bdp1Q571C7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms