Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrig2Q52KR2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms