Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdp2Q504M2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms