Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051142Q3V0M8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC051142Q3V0M8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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