Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms