Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms