Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkain3Q3URJ8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkain3Q3URJ8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkain3Q3URJ8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkain3Q3URJ8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkain3Q3URJ8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkain3Q3URJ8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkain3Q3URJ8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkain3Q3URJ8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkain3Q3URJ8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms