Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms