Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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