Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nom1Q3UFM5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms