Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms