Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TraddQ3U0V2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms