Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms