Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ogfod1Q3U0K8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms