Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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