Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3TTJ4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms