Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc102aQ3TMW1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms