Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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