Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

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Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Myo3bQ1EG27 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms