Protein–RNA interactions for Protein: Q18PI6

Cd84, SLAM family member 5, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd84Q18PI6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd84Q18PI6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms