Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms