Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atp8b1Q148W0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp8b1Q148W0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp8b1Q148W0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b1Q148W0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp8b1Q148W0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b1Q148W0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b1Q148W0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b1Q148W0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b1Q148W0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b1Q148W0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Atp8b1Q148W0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
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