Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms