Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms