Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms