Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms