Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms