Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms