Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms