Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms