Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms