Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnal1Q05A62 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnal1Q05A62 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms