Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top1Q04750 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms