Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms