Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms