Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms