Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IhhP97812 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IhhP97812 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IhhP97812 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IhhP97812 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IhhP97812 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IhhP97812 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IhhP97812 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms