Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms