Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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