Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms