Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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