Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Acta1P68134 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Acta1P68134 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Acta1P68134 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Acta1P68134 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Acta1P68134 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Acta1P68134 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Acta1P68134 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Acta1P68134 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Acta1P68134 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Acta1P68134 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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