Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps3P62908 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms